MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 plasmid pAPA32-012

Total Repeats: 2832

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017134	TCG	2	6	168167	168172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061736
2502	NC_017134	GAA	2	6	168192	168197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384061736
2503	NC_017134	TCA	2	6	168209	168214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384061736
2504	NC_017134	CTT	2	6	168249	168254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384061736
2505	NC_017134	C	6	6	168283	168288	0 %	0 %	0 %	100 %	384061736
2506	NC_017134	TGGT	2	8	168308	168315	0 %	50 %	50 %	0 %	384061736
2507	NC_017134	GCCA	2	8	168380	168387	25 %	0 %	25 %	50 %	384061736
2508	NC_017134	AC	3	6	168440	168445	50 %	0 %	0 %	50 %	384061736
2509	NC_017134	CGA	2	6	168480	168485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061736
2510	NC_017134	TG	3	6	168655	168660	0 %	50 %	50 %	0 %	384061736
2511	NC_017134	CCGC	2	8	168671	168678	0 %	0 %	25 %	75 %	384061736
2512	NC_017134	CAC	2	6	168679	168684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061736
2513	NC_017134	TG	3	6	168727	168732	0 %	50 %	50 %	0 %	384061736
2514	NC_017134	CCG	2	6	168986	168991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061736
2515	NC_017134	GAT	2	6	168997	169002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384061736
2516	NC_017134	T	6	6	169014	169019	0 %	100 %	0 %	0 %	384061736
2517	NC_017134	TGC	2	6	169370	169375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061737
2518	NC_017134	TGC	2	6	169378	169383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061737
2519	NC_017134	CGG	2	6	169436	169441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384061737
2520	NC_017134	CAC	2	6	169538	169543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061737
2521	NC_017134	GGT	2	6	169577	169582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384061737
2522	NC_017134	CAC	3	9	169591	169599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061737
2523	NC_017134	GGAT	2	8	169654	169661	25 %	25 %	50 %	0 %	384061737
2524	NC_017134	CAG	2	6	169795	169800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061737
2525	NC_017134	CGA	2	6	169844	169849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061737
2526	NC_017134	GCT	2	6	169890	169895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061737
2527	NC_017134	GGCA	2	8	169930	169937	25 %	0 %	50 %	25 %	384061737
2528	NC_017134	GAT	2	6	169938	169943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384061737
2529	NC_017134	GCC	3	9	170087	170095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061737
2530	NC_017134	CG	3	6	170114	170119	0 %	0 %	50 %	50 %	384061737
2531	NC_017134	TGG	2	6	170150	170155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384061737
2532	NC_017134	GCA	2	6	170235	170240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061737
2533	NC_017134	ACG	2	6	170284	170289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061737
2534	NC_017134	CCA	2	6	170292	170297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061737
2535	NC_017134	GAA	2	6	170359	170364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384061737
2536	NC_017134	CGT	2	6	170400	170405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061737
2537	NC_017134	CA	3	6	170415	170420	50 %	0 %	0 %	50 %	384061737
2538	NC_017134	CAC	2	6	170446	170451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061737
2539	NC_017134	GCC	2	6	170452	170457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061737
2540	NC_017134	TGAG	2	8	170516	170523	25 %	25 %	50 %	0 %	384061738
2541	NC_017134	TTTC	2	8	170546	170553	0 %	75 %	0 %	25 %	384061738
2542	NC_017134	CAG	2	6	170673	170678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061738
2543	NC_017134	CAGC	2	8	170703	170710	25 %	0 %	25 %	50 %	384061738
2544	NC_017134	CAG	2	6	170802	170807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061738
2545	NC_017134	GCA	2	6	170830	170835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061738
2546	NC_017134	GT	3	6	171079	171084	0 %	50 %	50 %	0 %	384061738
2547	NC_017134	CCA	2	6	171085	171090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061738
2548	NC_017134	GCC	2	6	171148	171153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061738
2549	NC_017134	CCA	2	6	171179	171184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061738
2550	NC_017134	GCC	2	6	171198	171203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061738
2551	NC_017134	CGC	2	6	171236	171241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061738
2552	NC_017134	CAG	2	6	171300	171305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061738
2553	NC_017134	GCCATC	2	12	171312	171323	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384061738
2554	NC_017134	AG	3	6	171415	171420	50 %	0 %	50 %	0 %	384061738
2555	NC_017134	GTG	2	6	171448	171453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384061738
2556	NC_017134	CAT	2	6	171465	171470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384061738
2557	NC_017134	GCA	2	6	171499	171504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061739
2558	NC_017134	GAA	2	6	171617	171622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384061739
2559	NC_017134	CA	3	6	171765	171770	50 %	0 %	0 %	50 %	384061739
2560	NC_017134	TCCGG	2	10	171808	171817	0 %	20 %	40 %	40 %	384061739
2561	NC_017134	GCA	2	6	171830	171835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061739
2562	NC_017134	GGC	2	6	171836	171841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384061739
2563	NC_017134	ATG	2	6	171843	171848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384061739
2564	NC_017134	TCA	2	6	171861	171866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384061739
2565	NC_017134	TCGCG	2	10	171868	171877	0 %	20 %	40 %	40 %	384061739
2566	NC_017134	CGG	2	6	171921	171926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384061739
2567	NC_017134	ACA	2	6	171972	171977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384061739
2568	NC_017134	CCCGG	2	10	172075	172084	0 %	0 %	40 %	60 %	384061740
2569	NC_017134	CAC	2	6	172210	172215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061740
2570	NC_017134	TCT	2	6	172392	172397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384061740
2571	NC_017134	CTGC	2	8	172404	172411	0 %	25 %	25 %	50 %	384061740
2572	NC_017134	GGC	2	6	172414	172419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384061740
2573	NC_017134	GGC	2	6	172487	172492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384061740
2574	NC_017134	CCG	2	6	172521	172526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061740
2575	NC_017134	GCA	2	6	172559	172564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061740
2576	NC_017134	GTC	2	6	172592	172597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061740
2577	NC_017134	CAG	2	6	172629	172634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061740
2578	NC_017134	GTCCG	2	10	172679	172688	0 %	20 %	40 %	40 %	384061740
2579	NC_017134	GCCC	2	8	172880	172887	0 %	0 %	25 %	75 %	384061740
2580	NC_017134	AGC	2	6	172895	172900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061740
2581	NC_017134	TGC	2	6	172946	172951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061740
2582	NC_017134	GC	3	6	172950	172955	0 %	0 %	50 %	50 %	384061740
2583	NC_017134	GCC	2	6	173044	173049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061740
2584	NC_017134	GCC	2	6	173204	173209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061741
2585	NC_017134	CAT	2	6	173262	173267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384061741
2586	NC_017134	GA	3	6	173360	173365	50 %	0 %	50 %	0 %	384061741
2587	NC_017134	AGC	2	6	173378	173383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061741
2588	NC_017134	CTC	2	6	173384	173389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384061741
2589	NC_017134	TGATC	2	10	173429	173438	20 %	40 %	20 %	20 %	384061741
2590	NC_017134	TGA	2	6	173491	173496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384061741
2591	NC_017134	CCA	2	6	173534	173539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061741
2592	NC_017134	TTC	2	6	173568	173573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384061741
2593	NC_017134	TCA	2	6	173582	173587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384061741
2594	NC_017134	GC	3	6	173595	173600	0 %	0 %	50 %	50 %	384061741
2595	NC_017134	CCA	2	6	173657	173662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061741
2596	NC_017134	ACG	2	6	173815	173820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061741
2597	NC_017134	CCA	2	6	173849	173854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061741
2598	NC_017134	ATG	2	6	173875	173880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384061741
2599	NC_017134	CGC	2	6	173909	173914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061741
2600	NC_017134	GCTG	2	8	173926	173933	0 %	25 %	50 %	25 %	384061741
2601	NC_017134	CGG	2	6	174002	174007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384061741
2602	NC_017134	GCA	2	6	174082	174087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061741
2603	NC_017134	AG	3	6	174134	174139	50 %	0 %	50 %	0 %	384061742
2604	NC_017134	ACG	2	6	174168	174173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061742
2605	NC_017134	AGG	2	6	174178	174183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384061742
2606	NC_017134	GGCA	2	8	174275	174282	25 %	0 %	50 %	25 %	384061742
2607	NC_017134	GCC	2	6	174291	174296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384061742
2608	NC_017134	AAT	2	6	174303	174308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384061742
2609	NC_017134	TTG	2	6	174322	174327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384061742
2610	NC_017134	TCA	2	6	174352	174357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384061742
2611	NC_017134	CAG	2	6	174408	174413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384061742
2612	NC_017134	TAA	2	6	174506	174511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384061742
2613	NC_017134	GAA	2	6	174993	174998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384061743
2614	NC_017134	ACACC	2	10	175002	175011	40 %	0 %	0 %	60 %	384061743
2615	NC_017134	TTC	2	6	175021	175026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384061743
2616	NC_017134	TGC	2	6	175033	175038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384061743
2617	NC_017134	GC	5	10	175063	175072	0 %	0 %	50 %	50 %	384061743
2618	NC_017134	TGG	2	6	175075	175080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384061743
2619	NC_017134	CAC	2	6	175083	175088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061743
2620	NC_017134	CCA	2	6	175162	175167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384061743
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2622	NC_017134	GC	3	6	175323	175328	0 %	0 %	50 %	50 %	384061743
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2743	NC_017134	TGTCC	2	10	183631	183640	0 %	40 %	20 %	40 %	384061749
2744	NC_017134	GAA	2	6	183717	183722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384061749
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2746	NC_017134	CGGG	2	8	183933	183940	0 %	0 %	75 %	25 %	384061750
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2832	NC_017134	C	6	6	190044	190049	0 %	0 %	0 %	100 %	384061753

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.